История отважного пирата по имени Харлок приковывает взор. Он когда-то в далёком прошлом решил покинуть людей и путешествовать на собственном космическом корабле «Аркадия». Он узнаёт, что Земля захвачена неземными силами из корпорации Гайя, которые не дают свободу людям и лишают их прекрасного будущего. Харлок решается отстоять Землю, которую когда-то покинул, но для этого ему нужна поддержка. Ему всё-таки удаётся найти новых друзей и быть защищённым в большом корабле. Удастся ли Харлоку с его новыми друзьями и неравными силами отвоевать родную Землю и уничтожить злейших врагов?